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    CUT-Tag技術服務-研究DNA與蛋白互作

    更新時間:2022-05-20

    訪問量:55

    廠商性質:生產廠家

    生產地址:

    簡要描述:
    CUT-Tag互作技術服務是研究DNA與蛋白互作的新技術。與ChIP-Seq相比,CUT-Tag不需要甲醛交聯和免疫共沉淀的過程,而是通過靶蛋白的抗體和Protein A的介導,使Protein A融合的Tn5轉座酶靶向并切割DNA,同時在序列兩端加上測序接頭,經PCR擴增后形成高通量測序文庫。
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    CUT-Tag互作技術服務-研究DNA與蛋白互作(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是研究DNA與蛋白互作的新技術。與ChIP-Seq相比,CUT&Tag不需要甲醛交聯和免疫共沉淀的過程,而是通過靶蛋白的抗體和Protein A的介導,使Protein A融合的Tn5轉座酶靶向并切割DNA,同時在序列兩端加上測序接頭,經PCR擴增后形成高通量測序文庫。

    CUT-Tag互作技術服務-研究DNA與蛋白互作實驗流程圖

    CUT&Tag流程圖.png

    細胞與ConA beads結合——細胞滲透性處理——一抗與目的蛋白特異性結合——二抗結合一抗放大信號——加入pA-Tn5與抗體結合——通過Mg2+激活轉座體,片段化目的蛋白結合的DNA,并加上接頭序列——DNA提取與擴增-高通量測序

     

    客戶提供材料 實驗過程圖

    凍存細胞:細胞數>10萬

    凍存組織:組織量>40 mg

    一抗(請使用ChIP級別的一抗,提供未稀釋的抗體原液,

    送樣前請將抗體的說明書發給我們,以便安排后續實驗

    高通量測序原始數據

    生物信息學分析結果

     

    使用CUT&Tag,鑒定H3K27me3在染色質水平上的peaks。與ChIP-seq相比,在相同Reads條件下,兩者的Peaks一致,并且CUT&Tag的信噪比更高、背景更低。


    參考文獻:

    Kaya-Okur HS, Wu SJ, Codomo CA, Pledger ES, Bryson TD, Henikoff JG, Ahmad K, Henikoff S. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nat Commun. 2019 Apr 29;10(1):1930. doi: 10.1038/s41467-019-09982-5.

     

    CUT&Tag,DAP-seq,ChIP-seq技術對比
    技術名稱 CUT&Tag DAP-seq ChIP-seq
    實驗模式 體內 體外 體內
    是否需要特異性抗體
    樣本適用性 對細胞活性要求高,不兼容冷凍樣本,能夠對極少量樣品進行分析 所有物種,各種組織器官,新鮮組織、凍存組織皆可 所有物種,各種組織器官,新鮮組織、凍存組織皆可
    信噪比 背景噪音低,所需測序深度少 噪音高,所需測序量相對較多 噪音高,所需測序量相對較多

     

     

     

     

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